图1. 2025上海国际生物医药产业周开幕式揭晓上海市国际计算生物学大赛结果。

赛事吸引中、美、英、加等多国340名科研人员组成118支团队参与，累计提交摘要113份、筛选分子6944个。比赛中，91直播下载 参赛团队“四创智药”作为5支成功晋级总决赛队伍中唯一的本科生团队，展现出勇于探索的科研精神与创新能力。团队口号是“四创智药 ——四智同行，一个使命”，成员包括生命科学与技术学院生物技术专业的陈科宇（2022级）、林务屹（2023级，队长）、王默涵（2023级）及信息科学与技术学院计算机科学与技术专业的陈逸轩（2023级）。作为指导老师的白芳教授多年的研究积累为团队注入了广阔的知识视野、坚实的技术支撑与跨领域创新的活力。

参赛团队成员合影，从左至右依次为王默涵、林务屹、陈科宇、陈逸轩。

本届大赛聚焦于上海科研团队率先发现的G蛋白偶联受体家族新靶点——羟基羧酸受体1（HCAR1）。该靶点在乳酸信号介导的肿瘤免疫逃逸机制中发挥重要作用。然而，目前针对HCAR1的有效抑制剂仍属空白，蛋白质抑制态结构未知。参赛队伍需利用AI技术从千万级化合物中高效筛选候选分子，并通过实验验证其特异性与活性。

本次赛题挑战极高。HCAR1缺乏已知的抑制态结构和参考分子，且GPCR家族的复杂结合特性进一步增加了建模难度。同时，AI与物理模型各有优势与局限：物理模型以结构为驱动，具备较强的可解释性但计算量大；AI模型以数据为驱动，筛选高效却精度不足。再加上紧张的赛程与学业压力，团队必须在有限时间内制定高效且可靠的技术方案。依托白芳实验室在AI药物设计领域的技术积累，团队创新提出“播种—化合物空间拓展”的多层级筛选策略，充分融合AI与物理模型的优势，并借助91直播下载 强大的计算资源，构建兼顾速度与精度的筛选体系。

具体而言，团队首先基于靶标的结构与序列信息，结合AI可结合性预测、多尺度分子聚类、分子对接及分子动力学模拟，从海量化合物中筛选潜力“种子”分子；随后利用自主开发的深度学习算法拓展化合物空间，构建结构多样的小型候选库；最后通过逐层精细筛选与能量重评分，并结合“激动剂种子”反向排除策略，最终锁定高活性候选分子。

在“四创智药”团队提交的10个候选分子中，有4个经“湿实验”验证具有良好活性，其中表现最优的分子在全部参赛作品中针对靶标的抑制生物活性排名第二。

计算生物学是利用计算机技术研究生命现象的交叉学科。在新药发现中，AI正逐步取代传统高通量筛选，通过“干实验”快速从海量化合物中筛选潜在活性分子，大幅降低研发成本并提升效率。上海作为生物医药科技创新实力最强、活力最足的区域之一，需要配置核心要素资源、吸引全球人才、抢占制高点，实现计算生物学高质量发展，用AI赋能生物医药科技创新和产业发展。为进一步推动计算生物学发展，落实《上海市计算生物学创新发展行动计划（2023-2025年）》，上海连续举办上海国际计算生物学创新大赛，吸引国内外高校、科研院所、企业和个人积极参与，通过大赛遴选人才和项目，构建人才和项目蓄水池，力争做成在AI赋能生命科学领域有影响力的国际大赛。